内田望(主人公)は、幼い頃にひと夏を一緒に過ごした従姉妹の黎明香澄に会いたくて、いっぷう変わった校風の聖紅闇学園にやってきた。下宿先も香澄の家なので、これからの学園生活は薔薇色になるはずだったが、香澄の周囲で奇怪な事件が起こり始め、望もまた、学園に渦巻く陰謀に巻き込まれていく。はたして、この学園では何が起こっているのか……!?